1991 йылдың 19 мартында [[Башҡорт ССР-ы Министрҙар Советы]] тарафынан «Башҡорт Совет Энциклопедияһын әҙерләү һәм нәшер итеү тураһында» ({{lang-ru|«О подготовке и издании Башкирской Советской Энциклопедии»}}) ҡарар ҡабул ителә. Уға ярашлы [[Тарих, тел һәм әҙәбиәт институты]] янында Башҡорт Совет Энциклопедияһы ғилми-ойоштороу советы (бүлеге) булдырыла<ref>[http://docs.cntd.ru/document/935100938 Постановление Совета Министров Башкирской ССР от 19 марта 1991 года «О подготовке и издании Башкирской Советской Энциклопедии»]</ref>. 1993 йылда Башҡортостан Республикаһы Министрҙар Советы һәм [[Башҡортостан Республикаһы Фәндәр академияһы]] ҡарарҙарына ярашлы, был бүлек нигеҙендә ацырымайырым ғилми учреждение — БР ФА-ның Башҡорт энциклопедияһының баш редакцияһы ойошторола<ref>{{cite web |url=http://www.bashinform.ru/news/102659-k-10-letiyu-so-dnya-obrazovaniya-nauchnogo-izdatelstva-quot-bashkirskaya-entsiklopediya-quot/|title=''Шушпанов Сергей.'' К 10-летию со дня образования научного издательства «Башкирская энциклопедия»|date=2003-02-04|publisher=[[Башинформ|«Башинформ»]]|accessdate=2015-07-09}}{{ref-ru}}</ref>. Башҡортостан Республикаһы Президенты [[Рәхимов Мортаза Ғөбәйҙулла улы|М. Ғ. Рәхимовтың]] 1995 йылдың 16 ғинуарында сыҡҡан «Башҡорт энциклопедияһын төҙөүҙөтөҙөүҙе тиҙләтеү буйынса саралар тураһында» ({{lang-ru|«О мерах по ускорению создания Башкирской энциклопедии»}}) указына ярашлы, БР ФА-ның Башҡорт энциклопедияһының баш редакцияһы «Башҡорт энциклопедияһы» ғилми нәшриәте тип үҙгәртелә<ref>[http://bashkortostan.news-city.info/docs/sistemay/dok_kegkzi.htm Указ Президента Республики Башкортостан от 16 января 1995 года «О мерах по ускорению создания Башкирской энциклопедии»]</ref>.